MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 3315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013203	GTTTAT	2	12	385575	385586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013203	CTC	2	6	387862	387867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_013203	A	6	6	387949	387954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013203	CA	3	6	387955	387960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_013203	CGC	2	6	387976	387981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_013203	TTGCA	2	10	388009	388018	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1007	NC_013203	TGA	2	6	388046	388051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013203	TA	3	6	388065	388070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013203	T	6	6	388076	388081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_013203	TGA	2	6	388089	388094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013203	GTT	2	6	388683	388688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013203	GTAT	2	8	388718	388725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013203	CTTT	2	8	388726	388733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_013203	GAT	2	6	388734	388739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013203	ATT	2	6	388770	388775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013203	TGT	2	6	388839	388844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013203	TTG	2	6	388845	388850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013203	GTA	2	6	388870	388875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013203	GTT	2	6	388886	388891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013203	AATAAG	2	12	390833	390844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013203	TA	4	8	390847	390854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013203	ATT	2	6	390881	390886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013203	TAC	2	6	390929	390934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013203	TAT	2	6	393369	393374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013203	AATACG	2	12	393377	393388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1026	NC_013203	A	6	6	393409	393414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013203	GTA	2	6	393423	393428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_013203	T	6	6	396614	396619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013203	CG	3	6	396708	396713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_013203	GCG	2	6	396887	396892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_013203	A	6	6	397005	397010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013203	CTTT	2	8	397023	397030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_013203	TCA	2	6	397051	397056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_013203	ATT	2	6	397057	397062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013203	ATT	2	6	397075	397080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_013203	T	6	6	397082	397087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013203	AT	3	6	397133	397138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013203	A	6	6	397170	397175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013203	CATG	2	8	397180	397187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_013203	ATG	2	6	397257	397262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013203	AGA	2	6	397289	397294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013203	AAT	2	6	397316	397321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013203	GAT	2	6	397357	397362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013203	GGA	2	6	397388	397393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013203	TTC	2	6	397424	397429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013203	TCA	2	6	399947	399952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013203	GAAAA	2	10	403945	403954	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013203	ATT	2	6	403985	403990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013203	A	6	6	407298	407303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013203	GTT	2	6	407399	407404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_013203	ACC	2	6	407430	407435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_013203	GAA	3	9	407530	407538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013203	TCCT	2	8	407574	407581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_013203	CTTG	2	8	407663	407670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_013203	TTA	2	6	407692	407697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013203	ACAT	2	8	410136	410143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_013203	A	6	6	410144	410149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013203	ATT	2	6	410186	410191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013203	A	6	6	410216	410221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_013203	TAG	2	6	410225	410230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013203	ATT	2	6	410265	410270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013203	AG	3	6	410324	410329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013203	CTG	2	6	411934	411939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_013203	ATG	2	6	411979	411984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013203	T	6	6	412012	412017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013203	A	6	6	412215	412220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013203	TCGG	2	8	412282	412289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_013203	ATGC	2	8	412295	412302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_013203	CTTT	2	8	413627	413634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_013203	GT	3	6	413692	413697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013203	A	7	7	414241	414247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013203	TAT	2	6	417105	417110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013203	AGG	2	6	417124	417129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013203	GTA	2	6	417151	417156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013203	GTA	2	6	417172	417177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_013203	TTC	2	6	421855	421860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_013203	T	6	6	421903	421908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013203	TTG	2	6	421928	421933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013203	TAAA	2	8	421971	421978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013203	TTG	2	6	421987	421992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013203	TTAT	2	8	421997	422004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013203	AAAT	2	8	422007	422014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013203	TGA	2	6	422075	422080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013203	TG	3	6	423843	423848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013203	AT	3	6	423871	423876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_013203	TAAA	2	8	423913	423920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013203	AGG	2	6	423963	423968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013203	GGT	2	6	425395	425400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013203	CTA	2	6	425429	425434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013203	TGT	2	6	425474	425479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013203	A	6	6	425495	425500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013203	AT	3	6	425546	425551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013203	AAG	2	6	425615	425620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_013203	TG	3	6	427027	427032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013203	GAT	3	9	427038	427046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013203	GAGG	2	8	427050	427057	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_013203	TCT	2	6	428399	428404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_013203	GAG	2	6	428417	428422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_013203	GTG	2	6	429970	429975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_013203	CAGA	2	8	429984	429991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_013203	GTG	2	6	429995	430000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013203	A	6	6	430030	430035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013203	CCT	2	6	430048	430053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_013203	ATTT	2	8	430116	430123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013203	T	6	6	430148	430153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013203	ATTG	2	8	431322	431329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013203	A	7	7	431335	431341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013203	CTC	2	6	432853	432858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_013203	TAG	2	6	432903	432908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013203	TAC	2	6	433526	433531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_013203	CAA	2	6	433540	433545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_013203	AAG	2	6	433548	433553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013203	GT	3	6	436965	436970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013203	GAA	2	6	436981	436986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_013203	AAG	2	6	440141	440146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013203	TAC	2	6	440164	440169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_013203	ATGA	2	8	440229	440236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013203	AGT	2	6	440253	440258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013203	AACCT	2	10	441277	441286	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1120	NC_013203	ACA	2	6	441306	441311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_013203	TA	3	6	441356	441361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013203	TTA	3	9	442498	442506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013203	TC	3	6	442560	442565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_013203	GTA	2	6	442642	442647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013203	AAAG	2	8	442679	442686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_013203	GAG	2	6	442727	442732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013203	ACA	2	6	443690	443695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_013203	CGC	2	6	443722	443727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_013203	TTA	2	6	443734	443739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_013203	TAA	2	6	443746	443751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013203	GGA	2	6	448999	449004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013203	AT	3	6	449647	449652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_013203	TA	3	6	449728	449733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_013203	AAAG	2	8	449734	449741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_013203	GA	3	6	450687	450692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_013203	TTGT	2	8	451225	451232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_013203	AGA	2	6	451234	451239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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